Detalle de: Design, characterization and optimal tuning of synthetic biocircuits for bioproduction with control of the metabolic load

LA INDUSTRIA BIOTECNOLOGICA DEL FUTURO IMMEDIATO HARA USO DE CIRCUITOS GENETICOS SINTETICOS EN MICROORGANISMOS (USADOS COMO FABRICAS CELULARES) PARA PRODUCIR PROTEINAS Y METABOLITOS DE IMPORTANCIA INDUSTRIAL. PARA ELLO HA DE HACER FRENTE A VARIOS PROBLEMAS CRITICOS QUE ACTUALMENTE LIMITAN LA APLICABILIDAD DE LA BIOLOGIA SINTETICA: EL DISEÑO RACIONAL DE CIRCUITOS GENETICOS SINTETICOS DE CRECIENTE COMPLEJIDAD, SU CARACTERIZACION EXPERIMENTAL Y AJUSTE ROBUSTO, Y SU ESCALADO INDUSTRIAL. UNO DE LOS PRINCIPALES FACTORES QUE DIFICULTA LA SOLUCION DE ESTOS PROBLEMAS ES LA ALTERACION NO DESEADA DEL COMPORTAMIENTO ESPERADO DE LOS CIRCUITOS DISEÑADOS COMO CONSECUENCIA DE FENOMENOS DE CARGA METABOLICA Y GENETICA DEBIDOS AL USO DE RECURSOS CELULARES COMPARTIDOS Y VARIANTES EN EL TIEMPO. GESTIONAR ESTOS FENOMENOS EXIGE EL REDISEÑO DE LOS CIRCUITOS Y LA ADICION DE MECANISMOS DE CONTROL REALIMENTADO A FIN DE MANTENER EL COMPORTAMIENTO DE DISEÑO ESPECIFICADO. EN ESTA LINEA, SYNBIOCONTROL ADOPTA LA BIOLOGIA SINTETICA COMO UNA DISCIPLINA PROPIA DE LA INGENIERIA, Y ENFATIZA LA APLICACION DE PRINCIPIOS Y METODOLOGIAS DE LA INGENIERIA: ESTRATEGIAS DE CONTROL REALIMENTADO, OPTIMIZACION COMPUTACIONAL, Y ANALISIS MULTIVARIANTE.PARA CONSEGUIR SUS OBJETIVOS, SYNBIOCONTROL INTEGRA (1) UN GRUPO ACADEMICO DE INGENIERIA DE SISTEMAS, CONTROL Y ESTADISTICA ESPECIALIZADO EN MODELADO Y CONTROL DE BIOPROCESOS, BIOLOGIA DE SISTEMAS Y SINTETICA, ESTADISTICA MULTIVARIANTE, MONITORIZACION, ESCALADO DE PROCESOS Y ANALISIS DE DATOS OMICOS (SB2CLAB/GIEM-UPV) Y (2) UN GRUPO DE INGENIERIA QUIMICA ESPECIALIZADO EN OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS, IDENTIFICACION Y DISEÑO OPTIMO EN BIOLOGIA DE SISTEMAS Y SINTETICA (IIM-CSIC). ADEMAS, INTEGRA COMO COLABORADORA ACTIVA A BIOPOLIS S.L. (HTTP://WWW.BIOPOLIS.ES/ES/INICIO/), UNA EMPRESA BIOTECNOLOGICA VALENCIANA LIDER EN ESPAÑA, Y PROVEEDORA DE I+D Y SERVICIOS DE PRODUCCION PARA LA INDUSTRIA AGROALIMENTARIA, FARMACEUTICA, QUIMICA Y ENERGETICA.EL SUBPROYECTO DEL IIM-CSIC ESTARA CENTRADO EN EL DESARROLLO DE METODOS DE DISEÑO ESTRUCTURAL, ANALISIS Y AJUSTE PARAMETRICO ROBUSTO DE CIRCUITOS GENETICOS SINTETICOS DE CONTROL. PARA ELLO HARA USO DE TECNICAS DE IDENTIFICACION OPTIMA, CUANTIFICACION DE INCERTIDUMBRE Y CONTROL OPTIMO INVERSO MEDIANTE OPTIMIZACION GLOBAL MULTI-OBJETIVO. POSTERIORMENTE, DESARROLLARA UN ESQUEMA AUTOMATIZADO DE DISEÑO PARA BIOLOGIA SINTETICA QUE PERMITA CONSIDERAR INCERTIDUMBRE A VARIOS NIVELES. ESTAS METODOLOGIAS SE IMPLEMENTARAN EN HERRAMIENTAS SOFTWARE EN CODIGO ABIERTO Y DE ACCESO PUBLICO, FACILITANDO LA DIFUSION DE LA BIOLOGIA SINTETICA COMO UN AREA DE LA INGENIERIA.BIOLOGÍA SINTÉTICA\ESCALADO\MÉTODOS MULTIVARIANTES\OPTIMIZACIÓN\CONTROL REALIMENTADO\PRINCIPIOS DE DISEÑO\BIOPRODUCCIÓN