Detalle de: Synthetic biology to improve bioprocesses: design, optimization, monitoring and control

SYNBIOFACTORY BUSCA DAR RESPUESTA A VARIOS RETOS PRACTICOS EN LA INTERFASE ENTRE LA BIOLOGIA SINTETICA, LA INGENIERIA DE SISTEMAS, Y LA INGENIERIA DE BIOPROCESOS.EL PROYECTO APLICARA BIOLOGIA SINTETICA (BS) A LA MEJORA DE BIOPRODUCCION INDUSTRIAL, CON ENFASIS EN EL PAPEL QUE PUEDEN JUGAR LOS METODOS DE DISEÑO PROPIOS DE LAS AREAS DE INGENIERIA: LA OPTIMIZACION, LA MONITORIZACION, Y EL CONTROL AUTOMATICO DE PROCESOS. EL OBJETIVO FINAL ES CONTRIBUIR A CONVERTIR LA BIOLOGIA SINTETICA EN UNA DISCIPLINA PROPIA DE LA INGENIERIA. SYNBIOFACTORY, POR TANTO, ENFATIZA LA APLICACION DE PRINCIPIOS Y METODOLOGIAS DE LA INGENIERIA A LA CONSTRUCCION Y CARACTERIZACION DE SISTEMAS BIOLOGICOS SINTETICOS IMPLEMENTADOS MEDIANTE INGENIERIA GENETICA. EN ESTE CONTEXTO, SYNBIOFACTORY HARA FRENTE A DOS PROBLEMAS DE LA INDUSTRIA DE BIOPROCESOS QUE COMPARTEN EL OBJETIVO SUBYACENTE DE ENTENDER Y CONTROLAR EL ESTADO DE MICROORGANISMOS PRODUCTORES DE METABOLITOS A FIN DE MAXIMIZAR EL RENDIMIENTO Y LA PRODUCTIVIDAD:- OBJETIVO 1: DESARROLLAR SISTEMAS EFICIENTES DE PRODUCCION PARA LA SINTESIS Y EXPRESION DE PROTEINAS, CON ESPECIAL INTERES EN EL CONTROL DE LA VARIABILIDAD EN LA EXPRESION Y LA INTERACCION ENTRE CIRCUITO Y ORGANISMO HUESPED.- OBJETIVO 2: DISEÑO RACIONAL Y OPTIMIZACION DE RUTAS METABOLICAS SINTETICAS PARA LA SINTESIS DE PRODUCTOS, CON ESPECIAL INTERES EN EL CONTROL DE FLUJOS METABOLICOS A FIN DE MAXIMIZAR RENDIMIENTO Y PRODUCTIVIDAD MINIMIZANDO EL EFECTO DE LA CARGA METABOLICA.SYNBIOFACTORY NO OLVIDA LOS ASPECTOS METODOLOGICOS, NI LA NECESIDAD ACTUAL QUE TIENE LA BS DE DISPONER DE PARTES BIOLOGICAS (BIOBRICKS), DISPOSITIVOS BIOLOGICOS, Y HERRAMIENTAS SOFTWARE QUE DESACOPLEN LOS PROCESOS DE DISEÑO E IMPLEMENTACION. POR TANTO, SE CONSIDERARAN DOS OBJETIVOS METODOLOGICOS TRANSVERSALES A LOS OBJETIVOS EJECUTIVOS ANTERIORES:- OBJETIVO 3: CONVERTIR LA BS EN UNA INGENIERIA, HACIENDO EL PROCESO DE DISEÑO MAS SISTEMATICO (ESTANDARIZADO), MODULAR, PREDECIBLE, ROBUSTO, ESCALABLE Y EFICIENTE.- OBJETIVO 4: IMPLEMENTACION DE METODOS EN CODIGO ABIERTO, Y "BIOBRICKS" DE ACCESO PUBLICO.PARA CONSEGUIR ESTOS OBJETIVOS, SE USARAN METODOS PROPIOS DE LA OPTIMIZACION MATEMATICA, LA INGENIERIA DE SISTEMAS Y AUTOMATICA, Y LA ESTADISTICA MULTIVARIANTE. ESTAS TECNOLOGIAS FACILITADORAS ESENCIALES, JUNTO CON LA INGENIERIA METABOLICA Y LA SINTESIS Y ENSAMBLAJE DE ADN, PERMITIRAN ALCANZAR LAS SOLUCIONES ADECUADAS. ASI, SYNBIOFACTORY INTEGRARA CINCO GRUPOS ACADEMICOS Y UNA EMPRESA BIOTECNOLOGICA: DOS GRUPOS DE INGENIERIA DE SISTEMAS Y CONTROL ESPECIALIZADOS EN MODELADO Y CONTROL DE BIOPROCESOS, Y BIOLOGIA DE SISTEMAS Y SINTETICA (GCSC-UPV,ML-UDG), UN GRUPO DE INGENIERIA QUIMICA ESPECIALIZADO EN OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS Y MODELADO EN BIOLOGIA DE SISTEMAS (IIM-CSIC), DOS GRUPOS DE ESTADISTICA EXPERTOS EN APLICACION DE LA ESTADISTICA MULTIVARIANTE A MODELADO, MONITORIZACION, ESCALADO DE PROCESOS, ANALISIS MASIVO DE DATOS, OPTIMIZACION METAHEURISTICA Y TOMA DE DECISIONES (GIEM-UPV,UPCT-UMU), Y LA EMPRESA BIOTECNOLOGICA BIOPOLIS S.L., EMPRESA LIDER EN ESPAÑA, Y PROVEEDORA DE I+D Y SERVICIOS DE PRODUCCION PARA INDUSTRIA AGROALIMENTARIA, FARMACEUTICA, QUIMICA Y ENERGETICA.BIOLOGÍA SINTÉTICA\MÉTODOS MULTIVARIANTES\ESCALADO\CONTROL REALIMENTADO\PRINCIPIOS DE DISEÑO\OPTIMIZACIÓN\BIOPRODUCCIÓN