Detalle de: Genomics of ancient crops and domestication

[EN] Plant domestication and the development of agriculture is a topic of interest in a wide variety of fields. Comparison of wild and domestic specimens holds the key to identifying the genetic basis of traits of interest in agriculture. From an evolutionary genomics perspective, domestication redirected plant development to meet human needs, sometimes even exposing the same wild ancestor to different selective pressures from which different crops evolved. Finally, the process itself was a milestone in human evolution, as it changed human societies and the way they interacted.

In our group we want to unveil the domestication process for different crops by using the genomic data of modern and ancient specimens. We use population genetics theory, biostatistic and bioinformatic tools that we develop to characterise genetic variation of ancient specimens and analyse it in the context of modern genetic variation. Our goal is to gain insights into the genetic architecture of past populations, the dispersal of domestic varieties through the globe and the identification of regions of the genome that are of agricultural interest. We are currently working towards the understanding of emmer wheat, barley and chickpea domestication. We also have projects on population genetics of domestic animals, namely a project on European domestic dogs from the Neolithic to the Roman Period and a project on modern goat breed characterisation.

[ES] La domesticación de plantas y el desarrollo de la agricultura es un tema de interés en una gran variedad de campos. La comparación de especímenes silvestres y domésticos es la clave para identificar la base genética de rasgos de interés en la agricultura. Desde el punto de vista de la genómica evolutiva, la domesticación reorientó el desarrollo de las plantas para satisfacer las necesidades humanas, a veces incluso exponiendo al mismo ancestro silvestre a distintas presiones selectivas de las que evolucionaron distintos cultivos. Por último, el proceso en sí fue un hito en la evolución humana, ya que cambió las sociedades humanas y su forma de interactuar.

En nuestro grupo queremos desvelar el proceso de domesticación de distintos cultivos utilizando los datos genómicos de especímenes modernos y antiguos. Utilizamos la teoría de la genética de poblaciones y las herramientas bioestadísticas y bioinformáticas que desarrollamos para caracterizar la variación genética de especímenes antiguos y analizarla en el contexto de la variación genética moderna. Nuestro objetivo es comprender mejor la arquitectura genética de las poblaciones del pasado, la dispersión de las variedades domésticas por todo el planeta y la identificación de regiones del genoma de interés agrícola. Actualmente trabajamos para comprender la domesticación del trigo emmer, la cebada y el garbanzo. También tenemos proyectos sobre genética de poblaciones de animales domésticos, concretamente un proyecto sobre perros domésticos europeos desde el Neolítico hasta la época romana y otro sobre caracterización de razas caprinas modernas.