Detalle de: Genética y pangenómica de cebadas mediterráneas para su adaptación a estreses abióticos, pre-mejora y mejora PID2022-142116OB-I00

TITULO: GENETICA Y PANGENOMICA DE CEBADAS MEDITERRANEAS PARA SU ADAPTACION A ESTRESES ABIOTICOS, PRE-MEJORA Y MEJORA (GENOBAR)PI1: BRUNO CONTRERAS-MOREIRAPI2: ANA M. CASASOTROS PARTICIPANTES: ERNESTO IGARTUA, FRANCISCO CIUDAD (ITACYL)ESTE PROYECTO ES LA CONTINUACION DE LINEAS DE INVESTIGACION QUE ESTAN EN MARCHA, A LA VEZ QUE INTEGRA NUEVOS OBJETIVOS BASADOS EN RESULTADOS PREVIOS Y AGREGA TECNOLOGIAS DE VANGUARDIA PARA LA EXPLORACION GENOMICA.PROPONEMOS TRES OBJETIVOS. EL PRIMERO ES LA CONTINUACION DE TRABAJOS SOBRE EL CONTROL GENETICO DE LA FLORACION EN CONDICIONES MEDITERRANEAS Y SU IMPACTO AGRONOMICO, EN KILOS POR HECTAREA. ESTAMOS TERMINANDO EL DESARROLLO DE LINEAS CASI ISOGENICAS CON NUEVAS COMBINACIONES ALELICAS. ESTAS HIPOTESIS SE BASAN EN LA COMPOSICION GENETICA DE LAS VARIEDADES ESPAÑOLAS Y EN ESTUDIOS PREVIOS DE MAPEO DE POBLACIONES. SE ESTUDIARAN EN CAMPO, EN CONDICIONES CONTROLADAS Y, PARCIALMENTE, POR TRANSCRIPTOMICA. EN ESTE OBJETIVO, TAMBIEN CONTINUAREMOS INVESTIGANDO EL EFECTO DE LA CALIDAD DE LA LUZ EN EL DESARROLLO DE LA CEBADA.EL SEGUNDO OBJETIVO ABARCA TODO EL PROCESO DE PRE-MEJORA Y MEJORA DE LA CEBADA. UNA SECCION ESTA DEDICADA A LA BUSQUEDA DE MATERIALES TOLERANTES. SE EVALUARA UN CONJUNTO DE AL MENOS 30 VARIEDADES LOCALES MEDITERRANEAS EN CONDICIONES DE SEQUIA, EN LA PLATAFORMA TRANSPIRA, ASI COMO SUS RESPUESTAS A ALTAS TEMPERATURAS EN INVERNADERO. EN OTRA SECCION SE INICIARA EL DESARROLLO DE UNA POBLACION CON OCHO PARENTALES (POBLACION MAGIC), ELEGIDOS ENTRE LAS VARIEDADES LOCALES EVALUADAS PARA TOLERANCIA A ESTRESES ABIOTICOS. EL OBJETIVO ES PROMOVER LA RECOMBINACION Y COMBINAR RESPUESTAS FAVORABLES DE LOS DIFERENTES MATERIALES. NO SE COMPLETARA DENTRO DEL PLAZO DEL PROYECTO. SE UTILIZARA PARA ESTUDIOS GENETICOS E IDENTIFICACION DE MATERIALES DE PREMEJORA. LA SECCION FINAL EVALUARA VARIOS MATERIALES EN UNA RED DE ENSAYOS DE CAMPO: LINEAS AVANZADAS DEL PROGRAMA DE MEJORAMIENTO, LINEAS DE UN PROGRAMA DE SELECCION GENOMICA EN UN CRUCE ELITE, NIL DEL PRIMER OBJETIVO, LINEAS DE INTROGRESION DE UN MUTANTE DE LA VIA ABA CON EFECTO EN LA TOLERANCIA A LA SEQUIA.EL TERCER OBJETIVO PRETENDE CONSTRUIR RECURSOS PANGENOMICOS PARA LA CEBADA MEDITERRANEA. LOS RECURSOS EXISTENTES ACTUALMENTE (20 ENSAMBLAJES DE GENOMA DE CEBADA DISPONIBLES PUBLICAMENTE, 70 ENSAMBLAJES DE BAJA PROFUNDIDAD DE VARIEDADES LOCALES MEDITERRANEAS DEL PROYECTO GENDIBAR, SECUENCIAS DE CAPTURA DE EXOMA PUBLICAS DEL PROYECTO WHEALBI, SECUENCIAS DE CAPTURA DE EXOMA PROPIAS), SE COMBINARAN CON LOS RESULTADOS DE NUEVA SECUENCIACION EJECUTADA EN ESTE PROYECTO. EN CONCRETO, ENSAMBLAREMOS EL GENOMA DE UNA CEBADA ESPAÑOLA UTILIZANDO PROCEDIMIENTOS DE ULTIMA GENERACION (LECTURAS LARGAS HIFI, HI-C, ISOSEQ), ASI COMO CARACTERIZAREMOS LOS TRANSCRIPTOMAS DE LAS CEBADAS AUTOCTONAS CARACTERIZADAS EN EL OBJETIVO 2 (UNAS 30). SE DESARROLLARAN GRAFOS DE HAPLOTIPOS QUE SOPORTARAN LA CONSULTA EFICIENTE DEL PANGENOMA, QUE SE PONDRAN A DISPOSICION DE LA COMUNIDAD CIENTIFICA Y DE LOS MEJORADORES. EL ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA TAMBIEN SE UTILIZARA PARA BUSCAR FIRMAS DE EXPRESION ESPECIFICAS EN DISTINTOS GRUPOS GENETICOS.CEBADA\MEDITERRANEO\ADAPTACION\MEJORA\PANGENOMICA