Detalle de: Combining Genomic Approaches to Study Host–Pathogen Relationships in Wheat and Septoria CNS2024-154812

EL PROYECTO GENEBLEND TIENE COMO OBJETIVO COMBINAR ENFOQUES GENOMICOS PARA ESTUDIAR LAS INTERACCIONES HOSPEDADOR-PATOGENO ENTRE EL TRIGO DURO Y LA ENFERMEDAD SEPTORIA TRITICI BLOTCH. ESTE PROYECTO BUSCA MEJORAR LA PREDICCION DE LA RESISTENCIA A ENFERMEDADES Y LOS RIESGOS DE BROTES UTILIZANDO MODELOS AVANZADOS DE PREDICCION GENOMICA Y LA SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO DE AISLADOS DE SEPTORIA Y VARIEDADES DE TRIGO DURO.OBJETIVOS1. PREDICCION GENOMICA DE RESISTENCIA A ENFERMEDADES: DESARROLLAR MODELOS PARA PREDECIR LA RESISTENCIA A SEPTORIA TRITICI BLOTCH EN TRIGO DURO MEDIANTE LA SECUENCIACION DE 100 AISLADOS DE SEPTORIA Y 200 VARIEDADES DE TRIGO. ESTO IMPLICARA IDENTIFICAR MARCADORES GENETICOS ASOCIADOS CON LA RESISTENCIA E INTEGRAR ESTA INFORMACION EN MODELOS PREDICTIVOS.2. PRUEBAS EXHAUSTIVAS EN INVERNADERO: REALIZAR EXPERIMENTOS EN INVERNADERO CON 100 AISLADOS DE SEPTORIA (Y 10 MAS EN LA VALIDACION) EN 200 VARIEDADES DE TRIGO DURO PARA VALIDAR LOS MODELOS DE PREDICCION GENOMICA, GENERANDO DATOS FENOTIPICOS ROBUSTOS PARA CORRELACIONAR CON PERFILES GENOMICOS.3. VALIDACION, OPTIMIZACION Y DIFUSION DEL CONOCIMIENTO: VALIDAR Y OPTIMIZAR MODELOS PREDICTIVOS EN CONDICIONES REALES UTILIZANDO NUEVOS AISLADOS DE SEPTORIA. ADEMAS, REALIZAR ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA PARA DETERMINAR REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS CON LA RESISTENCIA A ENFERMEDADES. DIFUNDIR EL CONOCIMIENTO Y LAS HERRAMIENTAS A TRAVES DE SESIONES DE CAPACITACION, TALLERES Y PUBLICACIONES.METODOLOGIA1. GENOMICA DEL HOSPEDADOR Y DEL PATOGENO: GENERAR DATOS GENOMICOS PARA LOS AISLADOS DE SEPTORIA E INTEGRARLOS CON LOS DATOS EXISTENTES DE TRIGO DURO. SE REALIZARA LA SECUENCIACION DEL GENOMA COMPLETO DE 100 AISLADOS DE SEPTORIA.2. CARACTERIZACION DE LA AGRESIVIDAD DE SEPTORIA: REALIZAR 110 EXPERIMENTOS EN INVERNADERO PARA PROBAR CADA AISLADO EN 200 VARIEDADES DE TRIGO DURO, EVALUANDO LA PROGRESION DE LA ENFERMEDAD Y LA RESISTENCIA.3. DESARROLLO DE MODELOS DE PREDICCION GENOMICA Y GWAS: CONSTRUIR MODELOS DE PREDICCION PARA DETERMINAR LA AGRESIVIDAD DE SEPTORIA Y BUSCAR VARIANTES GENOMICAS ASOCIADAS CON LA RESISTENCIA A ENFERMEDADES. ESTO INCLUYE MODELADO EN CAPAS, EXPLORACION DE MODELOS DE APRENDIZAJE, VALIDACION CRUZADA Y VALIDACION DE MODELOS DE PREDICCION EN NUEVOS EXPERIMENTOS DE CAMPO.IMPACTOEL PROYECTO AVANZARA SIGNIFICATIVAMENTE EN LA COMPRENSION DE LA PREDICCION DE RASGOS COMPLEJOS, MEJORARA LA PRECISION DE LA PREDICCION EN LA SELECCION GENOMICA Y PROPORCIONARA INFORMACION CRUCIAL SOBRE LAS INTERACCIONES HOSPEDADOR-PATOGENO. LA INTEGRACION DEL APRENDIZAJE AUTOMATICO Y LA REPRODUCCION ASISTIDA POR GENOMICA PROMETE MEJORAR LA PRODUCTIVIDAD AGRICOLA, ABORDANDO LOS DESAFIOS DE LA SEGURIDAD ALIMENTARIA Y EL CAMBIO CLIMATICO.DIFUSION Y COLABORACIONLOS RESULTADOS SE COMPARTIRAN CON AUDIENCIAS ACADEMICAS E INDUSTRIALES A TRAVES DE CONFERENCIAS, REVISTAS Y PLATAFORMAS EN LINEA. EL PROYECTO TAMBIEN FOMENTARA COLABORACIONES CON PROGRAMAS DE MEJORAMIENTO DE PLANTAS, INSTITUCIONES DE INVESTIGACION Y PROFESIONALES DE LA INDUSTRIA PARA IMPLEMENTAR LOS HALLAZGOS EN APLICACIONES PRACTICAS.SEPTORIA\GWAS\PREDICCION GENOMICA\TRIGO DURO