Detalle de: EXPLOTANDO LA INFORMACIÓN GENÓMICA DEL PATÓGENO PARA IDENTIFICAR NUEVOS DETERMINANTES DEL ÉXITO O FRACASO DEL TRATAMIENTO EN TUBERCULOSIS

TUBERCULOSIS ES LA MAYOR CAUSA DE MORBIBIDAD (10,6 MILLONES CASOS/AÑO) Y MORTALIDAD (1,6 MILLONES/AÑO) ENTRE LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, PROBABLEMENTE REEMPLAZANDO A COVID-19 EN LOS PROXIMOS AÑOS (COMO YA OCURRIA ANTES DE 2020). ADEMAS, DURANTE LA PANDEMIA SE HAN PRODUCIDO IMPORTANTES RETROCESOS EN EL CONTROL GLOBAL DE LA TUBERCULOSIS CON EL NUMERO DE MUERTES VOLVIENDO A SUBIR DESPUES DE VEINTE AÑOS Y CON UN 20% DE INFRADIAGNOSTICO ADICIONAL. A ESTO HAY QUE AÑADIR QUE LA TUBERCULOSIS RESISTENTE A ANTIBIOTICOS CAUSA MAS DE 250,000 MUERTES AL AÑO Y UN GRAN IMPACTO ECONOMICO. MEJORAR LOS TRATAMIENTOS DE TUBERCULOSIS, HACERLOS MAS CORTOS O INCLUSO PERSONALIZADOS SERIA UN CAMBIO RADICAL EN EL CONTROL GLOBAL DE LA TUBERCULOSIS (POR LO MENOS HASTA QUE HAYA UNA VACUNA DISPONIBLE). PARTICULARMENTE SI LAS RECIDIVAS PUEDEN EVITARSE. LAS RECIDIVAS, Y EN GENERAL EL FALLO DEL TRATAMIENTO, SON LA PRINCIPAL RAZON POR LA QUE MILLONES DE CASOS SON TRATADOS CON UN LARGO REGIMEN DE SEIS MESES Y CUATRO DROGAS. EN REALIDAD, EXISTE EVIDENCIA QUE MUCHOS DE ESOS CASOS NO NECESITAN UN TRATAMIENTO TAN LARGO, PERO AHORA MISMO NO PODEMOS PREDECIR QUIEN SE CURA ANTES O QUIEN VA A FALLAR. HASTA RECIENTEMENTE SE HA ASUMIDO QUE LOS FALLOS DE TRATAMIENTO TIENEN QUE VER CON EL PACIENTE O CON LAS CONDICIONES SOCIOECONOMICAS SIN TENER EN CUENTA EL PAPEL DE LA GENETICA DE LA BACTERIA MAS ALLA DEL DESARROLLO DE RESISTENCIAS A ANTIBIOTICOS. DATOS RECIENTES SIN EMBARGO DEMUESTRAN QUE HAY FACTORES DE LA BACTERIA, NO NECESARIAMENTE LIGADOS A RESISTENCIAS, QUE PUEDEN TENER UN PAPEL EN EL FALLO AL TRATAMIENTO. ESTOS MECANISMOS NO CANONICOS INCLUYEN LA RESILIENCIA, PERSISTENCIA O TOLERANCIA A LAS DROGAS O INCLUSO CAMBIOS SUTILES EN LA SENSIBILIDAD SIN LLEGAR A CONSIDERARSE RESISTENTES. LAS BASES GENETICAS DE ESTOS FENOMENOS, Y EN GENERAL DEL FALLO AL TRATAMIENTO, SO EN MUCHOS CASOS DESCONOCIDAS. EN ESTE PROYECTO PARTIREMOS DE LOS DATOS GENERADOS EN ANTERIORES PROYECTOS DEL PLAN NACIONAL PARA IDENTIFICAR NUEVOS FACTORES GENETICOS DE LOS PATOGENOS LIGADOS A FALLO AL TRATAMIENTO. CONTRARIAMENTE A COMO SE HACE NORMALMENTE, EMPEZAREMOS POR IDENTIFICAR REGIONES Y/O MUTACIONES EN MUESTRAS PROVENIENTES DE CASOS CLINICOS Y EN UN SEGUNDO PASO CARACTERIZAREMOS FENOTIPICAMENTE LAS REGIONES MAS PROMETEDORAS, ASI COMO EL POTENCIAL DIAGNOSTICO/PRONOSTICO DE LAS MUTACIONES SELECCIONADAS. PARA ELLO COMBINAREMOS EL I. DESCUBRIMIENTO DE NUEVAS REGIONES/MUTACIONES EN MILES DE CEPAS FENOTIPADAS PARA VARIAS DROGAS USANDO TRAYECTORIAS EVOLUTIVAS QUE DESARROLLAMOS EN (CHINER-OMS PNAS 2022) Y LO COMBINAREMOS II. CON MUTACIONES DE ULTRABAJA FRECUENCIA IDENTIFICADAS EN PACIENTES DE VALENCIA Y EN EL MARCO DE UN ENSAYO CLINICO EN MARCHA. FINALMENTE, ESTUDIAREMOS III. LAS CARACTERISTICAS FENOTIPICAS DE LAS REGIONES ENCONTRADAS CON CRISPRI Y DETERMINAREMOS LAS MUTACIONES MAS RELEVANTES Y CON POTENCIAL. A CONTRIBUIREMOS A INNOVAR EN LOS ENSAYOS CLINICOS AL IV. IMPLEMENTAR LA DIVERSIDAD GENETICA COMO MARCADORA TEMPRANA DE EXITO. SI TB-SUCCESS TIENE EXITO CONTRIBUIRA A ENTENDER EL PAPEL DE GENETICA DE LA BACTERIA EN EL FALLO AL TRATAMIENTO Y POR TANTO EN EL CONTROL GLOBAL DE LA TUBERCULOSIS, ALGO NECESARIO PARA ALCANZAR LOS OBJETIVOS DE DESARROLLO SOSTENIBLES. CONTRIBUYENDO A LOS ESFUERZOS GLOBALES QUE PERMITAN CONSEGUIR CURACIONES MEJORES Y MAS TEMPRANAS Y POR TANTO CONTRIBUIR A ROMPER EL CIRCULO VICIOSO ENTRE POBREZA Y TUBERCULOSIS QUE EXISTE EN LOS PAISES DEL SUR GLOBAL.TUBERCULOSIS\EVOLUCION\ENSAYOS CLINICOS\GENOMICA\MEDICINA PERSONALIZADA