Detalle de: Animal genomics

[EN] Research of the Animal Genomics Group is focused primarily on the elucidation of the genomic architecture of traits of agronomic interest (TAI) in pigs (fat deposition, intramuscular fat content and composition, prolificacy, immunity, sperm quality etc.) and goats (milk yield and quality and body and udder conformation traits, resistance to infectious diseases, etc). With this aim, and in close collaboration with other leading scientific institutions and industrial partners, we have mapped the genetic determinants of TAI by using high throughput genotyping and next generation sequencing techniques in porcine experimental crosses and commercial populations as well as in dairy goats. We have also used RNA-Seq to investigate the regulation of gene expression in organs with key biological functions on the physiology of traits under study (e.g. liver, muscle and mammary gland) as well as of sperm cells. We are currently working in the integration of data obtained from genome-wide association studies, RNA-Seq, whole genome sequencing and single-cell multi-omic analysis, to reach new insights into fundamental questions related with (i) the characterization of the genetic variation existing in the pig and goat genomes and the prediction of its functional impact; (ii) the genetic and epigenetic regulation of gene expression; and (iii) the molecular basis of phenotypic traits. One of the most important goals of our research is to identify causal mutations that could be used in selection schemes to optimize production performance and, simultaneously, obtain healthier and more nutritive food. An additional goal of the Animal Genomics Group is to investigate the genetic diversity of domestic animals and to understand the impact of selection and domestication on their genetic and phenotypic variation.

[ES] La investigación del Grupo de Genómica Animal se centra principalmente en la elucidación de la arquitectura genómica de fenotipos de interés ganadero (FIG) en cerdos (engorde, porcentaje y composición de la grasa intramuscular, prolificidad, inmunidad, calidad espermática, etc.) y cabras (producción de leche, composición de la leche y conformación corporal y mamaria, resistencia a enfermedades infecciosas etc.). Con este objetivo, y en estrecha colaboración con otras instituciones científicas y empresas, hemos cartografiado los determinantes genéticos de FIG mediante el uso de técnicas de genotipado de alto rendimiento y de secuenciación masiva (next generation sequencing) en cruces experimentales y poblaciones comerciales porcinas, así como en cabras lecheras. También hemos utilizado la secuenciación masiva de RNA (RNA-Seq) para investigar la regulación de la expresión génica en órganos con funciones biológicas clave en la fisiología de los caracteres bajo estudio (hígado, músculo y glándula mamaria, entre otros), así como de las células espermáticas. Actualmente estamos trabajando en la integración de datos obtenidos a partir de estudios de asociación de genoma completo (GWAS), RNA-Seq, secuenciación de genoma completo (WGS), y tecnologías multiómicas a nivel celular (single cell) con el fin de abordar cuestiones fundamentales relacionadas con (i) la caracterización de la variación genética existente en los genomas porcino y caprino y la predicción de su impacto funcional; (ii) la regulación genética y epigenética de la expresión génica; y (iii) la base molecular de los caracteres fenotípicos. Uno de los objetivos más importantes de nuestra actividad investigadora consiste en identificar mutaciones causales que puedan ser utilizadas en esquemas de selección para incrementar la eficiencia del sistema productivo y, simultáneamente, obtener un alimento más saludable y nutritivo. Un objetivo adicional del Grupo de Genómica Animal consiste en estudiar la diversidad genética de los animales domésticos y comprender el impacto de la selección y la domesticación sobre su variación genética y fenotípica.